土御門天皇は承久の乱後、承久3年（1221年）に土佐国へ遷幸、貞応2年（1223年）にはさらに阿波国に移り、約9年後の寛喜3年（1231年）に崩御し、その行在所は守護所に近い勝瑞（藍住町）に比定する説がある。人々は土御門天皇火葬塚の北に通称「天皇さん」と呼ぶ土御門天皇社を奉祀、阿波志には「土御門天皇廟 池谷村天皇山南麓に在り」とみえる。その後、明治8年（1875年）に丸山神社と改称（鳴門市史上）。
昭和15年（1940年）には紀元二千六百年記念行事として、社名を阿波神社に改め、火葬塚の北東に隣接する現在地に新たに社殿を造営した。県民挙げての奉賛と勤労祀仕によって昭和18年（1943年）に竣工し、本殿座祭を斎行、県社に列した。

（Wikipedia阿波神社より引用）